重點實驗室不僅擁有完備的室內科研設備平臺，而且與依托單位中國水產科學研究院南海水產研究所三個試驗站和海上實驗船隊一起形成了從海上調查和采樣、室內實驗分析、臨海實驗站實驗和產業(yè)化中試基地結合配套的研究設施配套格局。

　　目前實驗室獨立及整合依托單位資源已建成了完整的室內實驗與分析平臺、野外采樣和調查平臺以及臨海觀測與野外中試平臺三個大的公用平臺。其中室內實驗室擁有多臺大型儀器設備；臨海觀測與野外中試平臺分別分布于深圳和三亞；野外采樣和調查平臺包括一條兩千噸級科考船，這些平臺可以滿足實驗室科研項目的實際需要。

　　（1）室內試驗和分析平臺

　　實驗室擁有1000多平方米的實驗和辦公場地，1建立了海洋生態(tài)學實驗室、海洋分子生物學實驗室、微生物學實驗室、衛(wèi)星遙感實驗室以及標本館等功能齊備的實驗操作和研究平臺。

　　（2）臨海實驗觀測和野外中試平臺

　　本實驗室擁有3個野外觀測和中試基地，分別是深圳實驗基地、熱帶水產研究開發(fā)中心和花都實驗基地。除了本實驗室相關課題組使用這些臨海試驗站作為觀測基地和野外試驗基地與中試平臺外，國內海洋和漁業(yè)科學相關研究單位也大量來這里進行大量研究和調查。

　　（3）野外采樣和調查平臺

　　本實驗室依托單位中國水產科學研究院南海水產研究所具有完整的海上作業(yè)和研究的船隊，現(xiàn)有“南鋒”號海洋漁業(yè)科考船，它是我國第一艘自行設計、自行建造，擁有自主知識產權的綜合性海洋漁業(yè)科考船，也是目前亞洲噸位最大具備國際先進水平的漁業(yè)科考船。總長66.66M，排水量1980T，主機馬力1920KW，續(xù)航力8000NM，自持力60晝夜，定員45人。“南鋒”號科考船2010年投入使用以來，先后圓滿完成了西沙群島附近海域大洋性頭足類資源調查、中越北部灣口劃界的漁業(yè)資源狀況調查、南海西南部大陸架斜坡區(qū)漁業(yè)資源環(huán)境調查、南海漁業(yè)資源調查與評估等科考任務。