農業農村部南海漁業資源環境重點野外科學觀測試驗站于2005年由農業部正式命名。2010年，農業農村部啟動“海洋漁業與可持續發展”學科群建設，本站按要求更名為“農業農村部南海漁業資源環境科學觀測實驗站”，成為農業農村部第一批建設的農業科學觀測實驗站。
        從1979年農業農村部批復開展南海漁業資源環境監測工作至今，經過30余年不懈努力，本站已建設成為我國大陸南部唯一的、具有明顯熱帶亞熱帶區域代表性的海洋漁業資源與生態環境科學觀測實驗站。
        本站實行開放、流動、競爭、聯合的運行機制，對國內外開放，是南海漁業資源環境領域獲取原始資料和基礎數據、開展漁業綜合科學研究、服務漁業生產的重要科技創新平臺。
        主要研究方向：南海及其河口水域漁業資源動態監測與研究、漁業生態環境監測與質量評價、水產種質資源監測、保存與開發利用、漁業生物多樣性及珍稀瀕危水生野生動物監測與調查。